Spektroskopia i biospektroskopia - laboratorium

chemia

obowiązkowe

Student powinien mieć ukończony kurs matematyki, fizyki i chemii teoretycznej (kwantowej).

w sali

Ćwiczenia laboratoryjne ze spektroskopii molekularnej z naciskiem na zastosowania biologiczne i medyczne: spektroskopia NMR, UV-VIS, Ramana, dichroizm kołowy

W ramach pracowni odbywa się pięć ćwiczeń, na których student zaznajamia się z różnymi metodami spektroskopowymi i ich zastosowaniami w biologii i medycynie.

Ćwiczenia mają na celu demonstrację zastosowań metod prezentowanych na wykładzie do rozwiązania konkretnych problemów naukowych oraz poszerzenie wiedzy teoretycznej.

1. NMR1 - Zastosowanie spektroskopii NMR w metabolomice

2. NMR2 - Badanie oddziaływania białko-ligand za pomocą metod spektroskopii NMR

3. UV - Widma elektronowe reszt tryptofanowych w białkach

4. CD - Dichroizm kołowy białek i polipeptydów w zakresie dalekiego nadfioletu

5. R-IR - Analiza kwasów tłuszczowych przy użyciu spektroskopii oscylacyjnej (ramanowskiej i IR)

1. Skrypt "Jednowymiarowe widma NMR" J. Stanek, dostępny na stronie:

http://nmr.cent3.uw.edu.pl/for-students

2. Vignoli, Ghini, Meoni, Licari, Takis, Tenori, Turano, Luchinat (2019). High-Throughput Metabolomics by 1D NMR. Angew. Chem. Int. Ed. 58: 968 – 994.

3.Cala, Guillière, Krimm (2014). NMR-based analysis of protein–ligand interactions. Anal Bioanal Chem 406:943–956.

4. Lakowicz, J. R. (Ed.). (2013). Principles of fluorescence spectroscopy. Springer Science & Business Media.

5. Kelly, S. M., Jess, T. J., & Price, N. C. (2005). How to study proteins by circular dichroism. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Proteins and Proteomics, 1751(2), 119-139.

6. Kęcki Z., Podstawy spektroskopii molekularnej, PWN

7. Spektroskopia oscylacyjna od teorii do praktyki, red. Kamilla Małek, PWN

Student powinien znać podstawy teoretyczne oraz zastosowania biologiczne i medyczne metod spektroskopowych, umieć interpretować widma molekularne.

Ocena jest średnią z ocen z pięciu ćwiczeń, wystawionych na podstawie wejściówki, aktywności podczas ćwiczenia, wyjściówki i opisu.

Nieobecność na pracowni wymaga usprawiedliwienia. Na pracowni dodatkowej można uzupełnić zaległości. Do pracowni dodatkowych mogą przystąpić jedynie studenci, którym do zaliczenia pracowni brakuje nie więcej niż dwa ćwiczenia.

Obecność na zajęciach należy potwierdzić podpisem na liście obecności.