Wprowadzenie do metod projektowania leków
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | 1200-2CHMMO1L1 |
Kod Erasmus / ISCED: |
13.3
|
Nazwa przedmiotu: | Wprowadzenie do metod projektowania leków |
Jednostka: | Wydział Chemii |
Grupy: |
Moduł 1 Leki - od projektowania do wdrożenia (S2-PRK-CHM) |
Punkty ECTS i inne: |
2.00
|
Język prowadzenia: | polski |
Kierunek podstawowy MISMaP: | biologia |
Rodzaj przedmiotu: | obowiązkowe |
Założenia (lista przedmiotów): | Modelowanie molekularne dla projektowania leków A - laboratorium 1200-1CHMMOAL6 |
Założenia (opisowo): | Znajomość podstawowych metod modelowania i wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych. |
Tryb prowadzenia: | w sali |
Skrócony opis: |
Na pracowni zostaną przedstawione i wyjaśnione różnorodne metody stosowane przy komputerowym wspomaganiu projektowania (odkrywania i optymalizacji) leków. |
Pełny opis: |
- Dokowanie molekularne; wykorzystanie baz cząstek chemicznych do dokowania, virtual screening. - Ocena konformacji ligand-receptor, porównywanie energii wiązania. Metody oceny, macierz błędu, krzywe ROC oraz AUC oraz Współczynnik wzbogacenia (enrichment factor). - Uczenie maszynowe w projektowaniu leków: zastosowanie, trening i walidacja metod. - Projektowanie na podstawie znanych związków bądź cech (farmakofory), projektowanie analogów. - Leki peptydowe, dokowanie do białek, projektowanie i dokowanie przeciwciał. - Metoda FEP (free energy perturbation) wyznaczania różnic w sile wiązania leków. |
Literatura: |
--- |
Efekty uczenia się: |
Student zna założenia metod stosowanych do projektowania leków oraz prawidłowo interpretuje uzyskane wyniki. Umie wybrać odpowiednią metodę do osiągnięcia zakładanego celu, oraz zna ograniczenia poszczególnych metod, w zakresie ich dokładności i szybkości. Potrafi komunikować się na tematy dotyczące projektowania leków w stopniu umożliwiającym aktywne uczestnictwo w środowisku naukowym. |
Metody i kryteria oceniania: |
Wymagania związane z uczestnictwem w zajęciach – brak. Wymagane zaliczenie wszystkich ćwiczeń. W przypadku braku obecności na zajęciach, niezbędne jest zaliczenie ćwiczenia na pracowni dodatkowej. |
Praktyki zawodowe: |
Nie dotyczy |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2023/24" (zakończony)
Okres: | 2024-02-19 - 2024-06-16 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR LAB
CZ PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 30 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Sławomir Filipek | |
Prowadzący grup: | Sławomir Filipek, Marcin Lorkowski, Przemysław Miszta | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii.